血管内皮细胞生长因子受体2抑制剂三维药效团模型的构建
【作者】
陈军
[1,2] ;
黄晶晶
[1] ;
郑灿辉
[1] ;
吕加国
[1] ;
周有骏
[1] ;
朱驹
[1]
【关键词】
血管内皮生长因子受体2
抑
【摘要】目的构建血管内皮细胞生长因子受体2(VEGFR-2)抑制剂的三维药效团模型,为设计新型抑制剂建立理论模型。方法应用DiscoveryStudio2.5中的Catalyst模块,选取已确证结合于VEGFR-2活性腔、结合模式一致、抑制活性跨度5个数量级、结构具有多样性的30个抑制剂,其中21个分子作为训练集,余9个分子作为测试集产生三维药效团模型。结果最优药效团模型由1个氢键受体、2个疏水中心、1个芳环平面和4个排斥体积组成,预测相关性R为0.89。结论交叉验证结果表明药效团模型具有较好的预测能力,可用于数据库搜索筛选结构新颖的抑制VEGFR-2的先导化合物。
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