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烟雾病患者血清microRNA表达谱的初步筛选与分析

【作者】 戴冬伟 [1] ; 赵文元 [1] ; 鲁琼 [2] ; 黄清海 [1] ; 许奕 [1] ; 洪波 [1] ; 李强 [1] ; 韩国胜 [1] ; 伍强军 [1] ; 刘建民 [1]

【关键词】 脑底异常血管网病 微RNAs

摘要】目的 筛选并分析烟雾病microRNA(miRNA)表达谱,探讨其可能的发病机制。方法采用基因芯片检测10例烟雾病患者和10例正常对照血清,获得miRNA差异表达谱,用RT-PCR进行结果验证。通过目标预测程序TargetScan进行预测并得到差异表达的miRNAs。进一步通过基因本体论(GO)分析与通路分析诠释关键信号通路和可能参与烟雾病发病机制的miRNAs。结果根据基因芯片结果,发现有94个差异表达的miRNAs,其中上调50个,下调44个,若干个重要的miRNA家族亦同时被检测到。RT—PCR验证了miRNA-106b、miRNA-130a、miRNA-126、miRNA-125a-3p的差异表达,证明基因芯片筛查可靠。通路分析表明富集程度最高的是mTOR信号通路,具有16个潜在功能靶点。结论利用基因芯片初步筛选出烟雾病患者血清miRNA表达谱;生物信息学分析提示mTOR信号通路可能与烟雾病发病相关。

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        出版单位:《第二军医大学学报》编辑部
        单位地址:上海市杨浦区翔殷路800号第二军医大学学报编辑部
        邮编:200433